Oui rebaser est une bonne pratique et git flow n’empêche pas de le faire, bien au contraire mieux vaut le faire pour avoir de belles “bosses” de développement de features. 
Je n’ai rien à redire, je suis même plutôt content de voir cette lib C++ s’en aller vivement que tu vires naclb également.
Par contre pour scryptb, la librairie a été retirée : désormais c’est Node qui fournit la fonction.
Je n’ai pas pu aller au bout des TF mais a priori ça se passe bien.
Merger
Pour donner l’exemple sur cette MR, si ta branche avait été nommée feature/wotb-rs alors tu aurais pu merger de deux façons :
git flow feature finish wotb-rs
Ou bien avec Git (ou le bouton “Merge” de GitLab) :
git merge --no-ff feature/wotb-rs
Ce qui ferait une belle bosse, ou disons un bel arbre dans l’historique Git (entre autres bénéfices) :
Bon là je l’ai fait en local pour l’exemple, mais je te laisse merger