Shame on me !!! J’étais tellement enthousiaste de trouver une release, que j’y suis allé à fond sans m’apercevoir que j’installais une version X64 sur un ARM. 
Boulette de débutant 
Je ne sais pas si ta question était à vocation pédagogique au départ, mais elle m’a permis de comprendre mon erreur 
!
Donc je réponds quand même à ta question :
La config utilisée, Raspberry Pi 3 b+ , avec Raspbian Stretch dessus, rien de très exotique !
L’erreur venait quelle que soit la commande utilisée avec duniter. (start, version, ou sync par exemple)
Enfin, pour compiler, je l’ai fait avec yarn comme sur le tuto que tu m’avais montré, avec nodejs version 8.9.4